שיר היא תלמידת דוקטורט בחוג לתולדות האמנות, בוגרת תואר ראשון בארכאולוגיה ובתולדות האמנות ותואר שני בתולדות האמנות מהאוניברסיטה העברית, במסגרת התכנית לתלמידי מוסמך מצטיינים של בית הספר מנדל.

מחקר הדוקטורט שלה, שנכתב בהנחיית פרופ' רינה טלגם, עוסק במערכים קוסמולוגיים באמנות אגן הים התיכון, באמנות ההלניסטית, הרומית והנוצרית הקדומה בשלהי העת העתיקה. יצירות האמנות הללו מציגות תרגום חזותי של רעיונות מופשטים אודות טבע העולם ומספקות דרך כך תובנות על האופן בו אנשי העת העתיקה הבינו את הסדר הקוסמולוגי. המחקר מתמקד בדוגמאות המורכבות יותר, שבהן מוצגים מספר מרכיבים קוסמולוגיים במסגרת יצירה אחת, תוך נסיון לייצג מערכת שבמסגרתה פועלים הכוחות המניעים את העולם.

מחקר המוסמך שלה, "הייתה או לא הייתה: תיאור ירושלים בחיבור העלייה לרגל 'מסע מבורדו' (שנת 333)" עסק בניתוח של חיבור העלייה לרגל הנוצרי הראשון לארץ הקודש, באמצעות קריאה צמודה שלו בהשוואה למידע ארכאולוגי ולחיבורים בני התקופה. עבודתה זכתה בפרס טדי קולק לעבודת תיזה מצטיינת המוקדשת לעיר ירושלים. במהלך הלימודים גם זכתה במלגת Brenninkmeijer-Werhahn לשהות של סמסטר באוניברסיטה הגרגוריאנית האפיפיורית ברומא, שניתנה על ידי המרכז לחקר הנצרות באוניברסיטה העברית.